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生命条形码数据系统

(重定向自Barcode of Life Data System)

生命条形码数据系统(英语:Barcode of Life Data System,也称作 BOLDBOLD系统)是专门用于DNA条形码的WEB平台。[1][2]它是由加拿大生物多样性基因组学中心开发的基于云数据的DNA存储分析平台。它分别由四个模块组成:数据入口,教育入口,一个BINs(假定物种)注册中心,以及一个数据收集和分析工作台,该工作台为分析DNA序列提供在线平台。[2] 自2005年推出后,生命条形码数据系统增加了一系列功能(包括数据组织、数据验证、可视化数据和数据发表)。该系统的最新版本(第四版)于2017年推出,该版本改进了支持数据收集与分析的工具,(也改进了数据发布、引用和注释工具)。[3] 截至2020年11月16日,生命条形码数据系统已包含了18105种拥有正式名称的物种条形码序列(包括动物、植物、真菌与原生生物)(约890万个标本)。[4]

任何对DNA条形码感兴趣的研究员都可免费下载生命条形码数据系统。通过此产品的专门服务,它有助于发表符合国际核苷酸序列数据库中获得条形码标准的记录。由于其基于web的交付方式和高度灵活的数据安全系统,它还能有效支持需广泛研究的团队项目。[3]

BOLD的数据主要来自国际生命条形码协会(iBOL)从2010年至2015年间的项目“BARCODE 500K”。 该项目旨在获取五十万至五百万种标本的DNA条码记录数据。信息的分类均由来自世界各国的科学家,合作者和设施进行。数据的积累提高了DNA条码识别的精准度,并有助于实现生命条形码数据库的扩充。

参考文献

  1. ^ Ratnasingham, Sujeevan; Hebert, Paul D. N. A DNA-Based Registry for All Animal Species: The Barcode Index Number (BIN) System. PLoS ONE. 2013, 8 (7): e66213. ISSN 1932-6203. doi:10.1371/journal.pone.0066213.
  2. ^ 2.0 2.1 RATNASINGHAM, SUJEEVAN; HEBERT, PAUL D. N. BARCODING: bold: The Barcode of Life Data System (http://www.barcodinglife.org). Molecular Ecology Notes. 2007-01-24, 7 (3): 355–364. ISSN 1471-8278. doi:10.1111/j.1471-8286.2007.01678.x.
  3. ^ 3.0 3.1 BOLD Print Handbook for BOLD v4. www.boldsystems.org. [2020-11-16].
  4. ^ BOLDSYSTEMS. www.boldsystems.org. [2020-11-16].

外部链接


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